无菌包装是指将经过杀菌后已获得商业无菌状态的产品，封闭在已杀菌的容器中，在无菌环境下灌注，灌装后包装容器保持密封以防止再度感染，以期在不加防腐剂、不经冷藏条件下得到较长的货架寿命的包装方法。
按无菌包装的形式分为：无菌纸板包装设备、无菌杯式包装机、大袋无菌包装设备、塑料瓶/玻璃瓶无菌包装设备和塑料杯无菌包装设备等。
(1)无菌纸板包装设备
容量一般在200-1000ml。包装形式为砖形包和屋顶包。主要用于奶制品。果汁、饮料等的包装。以卷筒复合纸为包材，边灭菌、边成型，边充填、边整形、边封切、边黏角、贴吸管，直至成品。典型代表为利乐包。无菌包装机一般为立式机型，也有卧式的，但用户比较认同的是立式机型。它在液面下横封，可完全灌满不存空气，易于防止包装内存有微生物。
(2)大袋无菌包装设备
大袋无菌包装设备，使用预先制好并经辐射或其他特殊手段灭菌的带盖多层复合大袋，分全自动、半自动两种机型，从5kg到100kg甚至1，000～10，000kg，主要功能为上袋、计量充填、封盖和卸袋。
(3)塑料瓶、玻璃瓶无菌包装设备
采用药品无菌包装原理设计制造，一般具备洗瓶、倒瓶、灭菌、烘干、封闭式无菌灌装功能，并且诸功能的多台机器连接一起，全封闭式生产。分热灌装和冷灌装两种。
(4)塑料杯无菌包装设备
分片材成型、无菌充填、封盖、分切和非成型(使用已成型的杯子)灭菌充填、封盖两种机型，前者无菌最有保障，他用卷筒片材一边热成型一边无菌充填、封盖;后者因使用事先已制好的杯子，难免带有细菌，包装过程，灭菌要特别小心严谨。
